科学研究

PI

Magdalena J Koziol PI

电子邮件: mjk@cibr.ac.cn

电话:

实验室主页: https://dnalaboratory.org

教育经历

2003年-2007年 英国剑桥大学发育生物学,博士

2000年-2003年 英国莱斯特大学医学遗传学,学士

1997年-2003年 德国斯图加特大学物理学,学士

工作经历

2019年至今        北京脑科学与类脑研究中心,PI

2013年-2019年   剑桥大学格登研究所,Dr Sir John Gurdon组,博士后研究工作

2011年-2013年   耶鲁大学,Dr Antonio Giraldez组,博士后研究工作

2009年-2011年   哈佛大学布罗德学院,Dr John Rinn组,博士后研究工作

2007年-2009年   波斯顿咨询公司


荣誉及奖项

2006年               荣获美国科学促进会(AAAS)Science杂志科技卓越奖

2005年/2003年   剑桥大学三一学院,剑桥欧洲信托奖学金

2003年               作为优等生,受伊丽莎白女王二世邀请,访问白金汉宫

2003年/2002年   荣获医学遗传学专业优等生奖


研究概述

DNA,“生命的基石”,是人类健康的基础。化学修饰可以直接改变DNA,因此发现、研究这些修饰是理解人类大脑功能,健康和疾病的关键。DNA修饰可以影响DNA碱基,多年来,关于胞嘧啶甲基化的研究一直在广泛大量的进行,这些研究揭示了其在管理基因和大脑功能,以及在大脑疾病如癌症方面的作用。令人惊讶的是,DNA修饰会影响其他DNA这一事实却经常被忽略。因此,我采用了一些新的方法,试图发现脊椎动物基因组中的新型DNA修饰。作为原理论证,我在脊椎动物基因组中发现了新型DNA修饰,叫做甲基化脱氧腺苷(methylated deoxyadenosine,Koziol等, 2015)。这一发现开辟了全新的研究途径,同时开创了令人振奋的生物学新领域,这也是Koziol实验室目前一直在跟进的研究。除了研究目前已知的对大脑功能非常重要的这种新型DNA修饰外,Koziol实验室正在研究并旨在发现新型的DNA和RNA修饰,以及它们在大脑中的作用。在可能的情况下,我们会进一步探索如何利用我们的发现达到改善人类健康的目的。


发表文章

1. Pacini C, Bradshaw CR, Garrett NJ, Koziol MJ*. Characteristics and homogeneity of N6-methylation in human genomes. under revision, 2019

2. C Pacini, Koziol MJ*. Bioinformatics challenges and perspectives when studying the effect of epigenetic modifications on alternative splicing. Philosophical Transactions of the Royal Society B, 2018, doi: 10.1098/rstb.2017.0073

3. *Koziol MJ, Bradshaw CR, Allen GE, Costa ASH, Frezza C. Identification of methylated deoxyadenosines by DNA immunoprecipitation. Bio-Protocol, 2016, doi: 10.21769/BioProtoc.1990

4. *Koziol MJ, Bradshaw CR, Allen GE, Costa ASH, Frezza C, Gurdon JB. Identification of methylated deoxyadenosines in vertebrates reveals diversity in DNA modifications. Nature Structural & Molecular Biology, 2015, doi: 10.1038/nsmb.3145

5. *Koziol MJ, Gurdon JB. TCTP in development and cancer. Biochemistry Research International, 2012, doi: 10.1155/2012/105203

6. Cabili MN, Trapnell CB, Goff L, Koziol MJ, Tazon-Vega B, Regev A, Rinn LJ. Integrative annotation of human large non-coding RNAs reveals global properties and specific subclasses. Genes and Development, 2011, doi: 10.1101/gad.17446611

7. Huarte M, Guttman M, Feldser D, Garber M, Koziol MJ, Kenzelmann-Broz, Khalil AM, Zuk O, Amit I, Rabani M, Attardi LD, Regev A, Lander ES, Jacks T, Rinn JL. A large intergenic noncoding RNA induced by p53 mediates global gene repression in the p53 response. Cell, 2010, doi: 10.1016/j.cell.2010.06.040

8. Guttman M, Garber M, Levin JZ, Donaghey J, Robinson J, Adiconis X, Fan L, Koziol MJ, Gnirke A, Nusbaum C, Rinn JL, Lander ES, Regev A. Ab initio reconstruction of cell type-specific transcriptomes in mouse reveals the conserved multi-exonic structure of lincRNAs. Nature Biotechnology, 2010, doi: 10.1038/nbt.1633

9. Koziol MJ, Rinn JL. RNA traffic control of chromatin complexes. Current Opinions in Genetics & Development, 2010, doi: 10.1016/j.gde.2010.03.003

10. Koziol MJ, Garrett N, Gurdon JB. Tpt1 activates transcription of Oct4 and Nanog in transplanted somatic nuclei. Current Biology, 2007, doi: 10.1016/j.cub.2007.03.062

* Only corresponding author